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业界首发 | 中科新生命推出TMTpro 16标记蛋白质组服务

2020-03-06

中科新生命业界首发,推出TMTpro16标蛋白质组服务,采用Thermo Scientific TMTpro标签试剂,可实现一次性 16 标样品多通道标记,16个样本以内,仅一次标记和分级。

标记蛋白定量(TMT/ iTRAQ)是应用广泛的非靶向蛋白组定量分析技术,多样本同时标记平行性好,标记效率高,稳定性高。目前常用的是TMT 6标和11标,iTRAQ 4标和8标。可如果您的实验设计是43重复,或者处理较多,是53重复样本,如何解决?

方案1: 平均分布在三个标记组内


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Banch1

内标混样

A1

B1

C1

D1

Banch2

内标混样

A2

B2

C2

D2

Banch3

内标混样

A3

B3

C3

D3

增加三个内标‘搭桥’,即3个内标混样的标记上机,增加25%的费用。

方案2:随机分配在两个标记组内


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Banch1

A1

A2

A3

B1

B2

B3

C1

C2

Banch2

C3

D1

D2

D3





减少标记组, 一组样本分散在不同标记组中,这种标记方式选择性少,不同组之间重复性难保证,数据分析岂不是风险更高? 

如何让设计的标记方案数据更加可靠、费用更低?没错,就是它----- TMTpro 16 plex

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让我们近距离了解它的强大之处:

²  标记原理:

TMTpro 标签结构与现有 TMT 标签结构类似,仍为同量异序和胺活性,但在长间隔区和异丁基脯氨酸质量报告区不同。在 MS/MS 裂解之后,每个 TMTpro 标签在高分辨率 MS/MS 质谱的低质量区域生成一个唯一的报告质量(例如 TMTpro 126-134Da),用于蛋白质表达水平的相对定量。


²  特色优势

1.数据更可靠:16个样本内消除多批次标记不平行问题,标记批次减少进一步减少定量数据丢失。如下图,对30个样本重复采用TMT11标记三批次与TMT16标记两批次的结果进行比较。TMT16标两批次标记减少了重复之间缺失值,使得可定量蛋白数提升达20%


2.价格更便宜:12个样本为例,TMTpro 16标只需在1批次内标记,省去加入内标混样的额外费用,费用可省近万元。


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批次1

A1

A2

A3

B1

B2

B3

C1

C2

C2

D1

D2

D3

 

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